Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms