Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms