Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms