Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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