Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tpm2P58774 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms