Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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