Protein–RNA interactions for Protein: P51943

Ccna2, Cyclin-A2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccna2P51943 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccna2P51943 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms