Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cav1P49817 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cav1P49817 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cav1P49817 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cav1P49817 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cav1P49817 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cav1P49817 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cav1P49817 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cav1P49817 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cav1P49817 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cav1P49817 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cav1P49817 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cav1P49817 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cav1P49817 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cav1P49817 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cav1P49817 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cav1P49817 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cav1P49817 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cav1P49817 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cav1P49817 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cav1P49817 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cav1P49817 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cav1P49817 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cav1P49817 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cav1P49817 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cav1P49817 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cav1P49817 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cav1P49817 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cav1P49817 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cav1P49817 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cav1P49817 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cav1P49817 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cav1P49817 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cav1P49817 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cav1P49817 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cav1P49817 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cav1P49817 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cav1P49817 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cav1P49817 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cav1P49817 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cav1P49817 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cav1P49817 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cav1P49817 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cav1P49817 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cav1P49817 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cav1P49817 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cav1P49817 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cav1P49817 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cav1P49817 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cav1P49817 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cav1P49817 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cav1P49817 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cav1P49817 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cav1P49817 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cav1P49817 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cav1P49817 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cav1P49817 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cav1P49817 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cav1P49817 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cav1P49817 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cav1P49817 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cav1P49817 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cav1P49817 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cav1P49817 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cav1P49817 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cav1P49817 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cav1P49817 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cav1P49817 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cav1P49817 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cav1P49817 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cav1P49817 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cav1P49817 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cav1P49817 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cav1P49817 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cav1P49817 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cav1P49817 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cav1P49817 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cav1P49817 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cav1P49817 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cav1P49817 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cav1P49817 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cav1P49817 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cav1P49817 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cav1P49817 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cav1P49817 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cav1P49817 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cav1P49817 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cav1P49817 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms