Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CitP49025 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CitP49025 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CitP49025 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CitP49025 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CitP49025 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CitP49025 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CitP49025 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CitP49025 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CitP49025 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CitP49025 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CitP49025 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CitP49025 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CitP49025 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CitP49025 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CitP49025 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CitP49025 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CitP49025 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CitP49025 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CitP49025 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CitP49025 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CitP49025 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CitP49025 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CitP49025 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CitP49025 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CitP49025 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CitP49025 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CitP49025 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CitP49025 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CitP49025 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CitP49025 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CitP49025 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CitP49025 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CitP49025 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CitP49025 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CitP49025 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CitP49025 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CitP49025 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CitP49025 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CitP49025 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CitP49025 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CitP49025 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CitP49025 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CitP49025 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CitP49025 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CitP49025 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CitP49025 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CitP49025 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CitP49025 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CitP49025 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CitP49025 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CitP49025 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CitP49025 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CitP49025 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CitP49025 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CitP49025 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CitP49025 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CitP49025 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CitP49025 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CitP49025 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CitP49025 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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