Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrbP28704 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrbP28704 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrbP28704 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrbP28704 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrbP28704 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrbP28704 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrbP28704 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrbP28704 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrbP28704 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrbP28704 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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