Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
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Hoxd10P28359 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
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Hoxd10P28359 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Hoxd10P28359 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Hoxd10P28359 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Hoxd10P28359 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Hoxd10P28359 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Hoxd10P28359 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Hoxd10P28359 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd10P28359 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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