Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tap1P21958 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tap1P21958 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tap1P21958 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tap1P21958 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tap1P21958 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tap1P21958 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tap1P21958 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tap1P21958 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tap1P21958 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tap1P21958 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tap1P21958 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tap1P21958 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tap1P21958 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tap1P21958 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tap1P21958 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tap1P21958 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tap1P21958 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tap1P21958 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tap1P21958 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tap1P21958 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tap1P21958 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tap1P21958 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tap1P21958 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tap1P21958 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tap1P21958 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tap1P21958 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tap1P21958 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tap1P21958 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tap1P21958 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tap1P21958 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tap1P21958 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tap1P21958 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tap1P21958 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tap1P21958 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tap1P21958 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tap1P21958 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tap1P21958 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tap1P21958 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tap1P21958 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tap1P21958 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tap1P21958 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tap1P21958 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tap1P21958 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tap1P21958 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tap1P21958 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tap1P21958 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tap1P21958 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tap1P21958 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tap1P21958 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tap1P21958 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tap1P21958 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tap1P21958 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tap1P21958 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Tap1P21958 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tap1P21958 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tap1P21958 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tap1P21958 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tap1P21958 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tap1P21958 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tap1P21958 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tap1P21958 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tap1P21958 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tap1P21958 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tap1P21958 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tap1P21958 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tap1P21958 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tap1P21958 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tap1P21958 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tap1P21958 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tap1P21958 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tap1P21958 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tap1P21958 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tap1P21958 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tap1P21958 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tap1P21958 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tap1P21958 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tap1P21958 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tap1P21958 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tap1P21958 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tap1P21958 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tap1P21958 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tap1P21958 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tap1P21958 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tap1P21958 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tap1P21958 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tap1P21958 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tap1P21958 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tap1P21958 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tap1P21958 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tap1P21958 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tap1P21958 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tap1P21958 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tap1P21958 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tap1P21958 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tap1P21958 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tap1P21958 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tap1P21958 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tap1P21958 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tap1P21958 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms