Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csn1s1P19228 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csn1s1P19228 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csn1s1P19228 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csn1s1P19228 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csn1s1P19228 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csn1s1P19228 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csn1s1P19228 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Csn1s1P19228 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csn1s1P19228 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csn1s1P19228 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csn1s1P19228 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csn1s1P19228 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csn1s1P19228 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csn1s1P19228 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csn1s1P19228 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csn1s1P19228 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csn1s1P19228 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csn1s1P19228 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csn1s1P19228 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csn1s1P19228 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csn1s1P19228 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csn1s1P19228 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csn1s1P19228 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csn1s1P19228 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csn1s1P19228 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csn1s1P19228 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csn1s1P19228 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csn1s1P19228 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csn1s1P19228 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csn1s1P19228 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csn1s1P19228 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Csn1s1P19228 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Csn1s1P19228 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csn1s1P19228 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms