Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CCL3L1P16619 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CCL3L1P16619 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CCL3L1P16619 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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