Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms