Protein–RNA interactions for Protein: P01653

Ig kappa chain V-V region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01653 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01653 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01653 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01653 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01653 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01653 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01653 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01653 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01653 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01653 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01653 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01653 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01653 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01653 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01653 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01653 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01653 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01653 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01653 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01653 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01653 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01653 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01653 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01653 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01653 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01653 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01653 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01653 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01653 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01653 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01653 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01653 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01653 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01653 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01653 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01653 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01653 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01653 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01653 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01653 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01653 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01653 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01653 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01653 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01653 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01653 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01653 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01653 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01653 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01653 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01653 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01653 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01653 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01653 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01653 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01653 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01653 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01653 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01653 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01653 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01653 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01653 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms