Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top3aO70157 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Top3aO70157 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Top3aO70157 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Top3aO70157 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms