Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cited2O35740 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms