Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Casq1O09165 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Casq1O09165 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Casq1O09165 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Casq1O09165 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Casq1O09165 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Casq1O09165 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Casq1O09165 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Casq1O09165 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Casq1O09165 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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