Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MttpO08601 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MttpO08601 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MttpO08601 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MttpO08601 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MttpO08601 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MttpO08601 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MttpO08601 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MttpO08601 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MttpO08601 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MttpO08601 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MttpO08601 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MttpO08601 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MttpO08601 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MttpO08601 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MttpO08601 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MttpO08601 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MttpO08601 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MttpO08601 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MttpO08601 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MttpO08601 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MttpO08601 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MttpO08601 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MttpO08601 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MttpO08601 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MttpO08601 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MttpO08601 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MttpO08601 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MttpO08601 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MttpO08601 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MttpO08601 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MttpO08601 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MttpO08601 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MttpO08601 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MttpO08601 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MttpO08601 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MttpO08601 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MttpO08601 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MttpO08601 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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MttpO08601 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MttpO08601 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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MttpO08601 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MttpO08601 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MttpO08601 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MttpO08601 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MttpO08601 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MttpO08601 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MttpO08601 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MttpO08601 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MttpO08601 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MttpO08601 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MttpO08601 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MttpO08601 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MttpO08601 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MttpO08601 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MttpO08601 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MttpO08601 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MttpO08601 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MttpO08601 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MttpO08601 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MttpO08601 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MttpO08601 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MttpO08601 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MttpO08601 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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MttpO08601 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MttpO08601 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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MttpO08601 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MttpO08601 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MttpO08601 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MttpO08601 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MttpO08601 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MttpO08601 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MttpO08601 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MttpO08601 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MttpO08601 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MttpO08601 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MttpO08601 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MttpO08601 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MttpO08601 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MttpO08601 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MttpO08601 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MttpO08601 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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MttpO08601 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MttpO08601 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MttpO08601 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MttpO08601 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MttpO08601 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MttpO08601 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MttpO08601 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MttpO08601 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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