Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms