Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ilf3Q9Z1X4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms