Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VarsQ9Z1Q9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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