Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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SNX13Q9Y5W8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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SNX13Q9Y5W8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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SNX13Q9Y5W8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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SNX13Q9Y5W8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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SNX13Q9Y5W8 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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SNX13Q9Y5W8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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SNX13Q9Y5W8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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SNX13Q9Y5W8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SNX13Q9Y5W8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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SNX13Q9Y5W8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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SNX13Q9Y5W8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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