Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NRXN3Q9Y4C0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRXN3Q9Y4C0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms