Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Npas3Q9QZQ0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms