Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY15

Ddx25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx25Q9QY15 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ddx25Q9QY15 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx25Q9QY15 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms