Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Prg4Q9JM99 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Prg4Q9JM99 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Prg4Q9JM99 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Prg4Q9JM99 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Prg4Q9JM99 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Prg4Q9JM99 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Prg4Q9JM99 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Prg4Q9JM99 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Prg4Q9JM99 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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