Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus3Q9JI38 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms