Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES46

Parvb, Beta-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvbQ9ES46 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms