Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms