Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzd9Q9D9M4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzd9Q9D9M4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzd9Q9D9M4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzd9Q9D9M4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzd9Q9D9M4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzd9Q9D9M4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzd9Q9D9M4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdzd9Q9D9M4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzd9Q9D9M4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzd9Q9D9M4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzd9Q9D9M4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzd9Q9D9M4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzd9Q9D9M4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzd9Q9D9M4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzd9Q9D9M4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzd9Q9D9M4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzd9Q9D9M4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzd9Q9D9M4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzd9Q9D9M4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzd9Q9D9M4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzd9Q9D9M4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzd9Q9D9M4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzd9Q9D9M4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzd9Q9D9M4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzd9Q9D9M4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdzd9Q9D9M4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Pdzd9Q9D9M4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzd9Q9D9M4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzd9Q9D9M4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzd9Q9D9M4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzd9Q9D9M4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Pdzd9Q9D9M4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzd9Q9D9M4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Pdzd9Q9D9M4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Pdzd9Q9D9M4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzd9Q9D9M4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzd9Q9D9M4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzd9Q9D9M4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdzd9Q9D9M4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Pdzd9Q9D9M4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Pdzd9Q9D9M4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdzd9Q9D9M4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdzd9Q9D9M4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdzd9Q9D9M4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Pdzd9Q9D9M4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdzd9Q9D9M4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdzd9Q9D9M4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdzd9Q9D9M4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdzd9Q9D9M4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Pdzd9Q9D9M4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Pdzd9Q9D9M4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Pdzd9Q9D9M4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdzd9Q9D9M4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdzd9Q9D9M4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdzd9Q9D9M4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdzd9Q9D9M4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Pdzd9Q9D9M4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdzd9Q9D9M4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdzd9Q9D9M4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdzd9Q9D9M4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdzd9Q9D9M4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdzd9Q9D9M4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdzd9Q9D9M4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdzd9Q9D9M4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdzd9Q9D9M4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdzd9Q9D9M4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdzd9Q9D9M4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdzd9Q9D9M4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdzd9Q9D9M4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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