Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Ubxn11Q9D572 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Ubxn11Q9D572 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Ubxn11Q9D572 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Ubxn11Q9D572 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Ubxn11Q9D572 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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