Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc130Q9D516 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc130Q9D516 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc130Q9D516 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc130Q9D516 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc130Q9D516 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ccdc130Q9D516 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ccdc130Q9D516 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ccdc130Q9D516 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ccdc130Q9D516 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc130Q9D516 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc130Q9D516 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc130Q9D516 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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