Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F8

Toporsl, Topoisomerase I-binding, arginine/serine-rich-like, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ToporslQ9D2F8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ToporslQ9D2F8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms