Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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