Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms