Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT0

Tmx1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmx1Q8VBT0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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Tmx1Q8VBT0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Tmx1Q8VBT0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Tmx1Q8VBT0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Tmx1Q8VBT0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmx1Q8VBT0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmx1Q8VBT0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmx1Q8VBT0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmx1Q8VBT0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmx1Q8VBT0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmx1Q8VBT0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmx1Q8VBT0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmx1Q8VBT0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmx1Q8VBT0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmx1Q8VBT0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmx1Q8VBT0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmx1Q8VBT0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmx1Q8VBT0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmx1Q8VBT0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmx1Q8VBT0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmx1Q8VBT0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmx1Q8VBT0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmx1Q8VBT0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmx1Q8VBT0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmx1Q8VBT0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmx1Q8VBT0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms