Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Atg16l1Q8C0J2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Atg16l1Q8C0J2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Atg16l1Q8C0J2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Atg16l1Q8C0J2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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