Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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FarsaQ8C0C7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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FarsaQ8C0C7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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FarsaQ8C0C7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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FarsaQ8C0C7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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FarsaQ8C0C7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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FarsaQ8C0C7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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FarsaQ8C0C7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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FarsaQ8C0C7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms