Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy1Q8BIJ7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms