Protein–RNA interactions for Protein: Q80V63

Prdm4, PR domain zinc finger protein 4, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm4Q80V63 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Prdm4Q80V63 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Prdm4Q80V63 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Prdm4Q80V63 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm4Q80V63 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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