Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180.2 ms