Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl2Q6PA06 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms