Protein–RNA interactions for Protein: Q6A026

Pds5a, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pds5aQ6A026 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pds5aQ6A026 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pds5aQ6A026 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pds5aQ6A026 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pds5aQ6A026 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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