Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Znf260Q62513 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Znf260Q62513 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Znf260Q62513 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Znf260Q62513 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Znf260Q62513 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Znf260Q62513 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Znf260Q62513 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Znf260Q62513 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Znf260Q62513 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Znf260Q62513 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Znf260Q62513 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Znf260Q62513 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Znf260Q62513 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf260Q62513 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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