Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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PtprnQ60673 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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PtprnQ60673 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PtprnQ60673 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PtprnQ60673 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PtprnQ60673 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PtprnQ60673 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PtprnQ60673 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PtprnQ60673 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PtprnQ60673 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PtprnQ60673 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PtprnQ60673 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprnQ60673 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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PtprnQ60673 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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PtprnQ60673 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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PtprnQ60673 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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PtprnQ60673 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprnQ60673 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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