Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynaQ5G5D5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms