Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox10Q04888 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms