Protein–RNA interactions for Protein: P99024

Tubb5, Tubulin beta-5 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb5P99024 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb5P99024 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms